尽管自新中国成立以来,中国先后开展了多种多样的区划、规划和分区,但更多的是侧重于单项要素或陆地生态系统,尤其是缺乏考虑陆地生态系统与水生态系统、社会经济系统之间的相互作用,未能更好地指导区域经济发展与水环境保护。目前国内现有的有关水生态功能分区(区划)还存在以下问题。

D现有的许多区划,包括单要素区划、综合区划和生态功能区划,更多的是定性考虑不同要素之间的相互作用关系,但是对于生态系统之间的功能联系考虑得不足。@现有的区划和功能分区往往对自然要素考虑得较多,对人类活动和行政地域的社会经济活动考虑得相对较少;未能给全国的主题功能区划,流域生态补偿,流域上下游、左右岸之间协调发展提供科学基础 ;缺乏将自然属性的区划和区域社会经济发展联系起来,有效地保护生态系统的功能的依据。3现有区划更多的是以人类需求为中心,考虑人类活动和社会经济发展对水资源的需求,未充分考虑生物、陆地生态系统对水环境的需求及协调两者关系的措施;目前开展的大尺度流域调水就是一个明确的例子,为了人类生活和经济发展,不惜从更远的地方调水来支撑经济的发展,未能将区域经济发展和水体生态系统的净化能力有机地结合在一起。@目前的水体功能分区管理多以水体现状使用功能为基础进行划分,缺乏对水生态系统完整性的考虑,未考虑水体的区域分异性,难以在水资源和水环境管理中实现因地制宜。仅以水质标准为管理目标,就事论事,尚未考虑水体生物指标、生态需水要求,制定合理的分区管理方案。(5中国的水生态功能分区刚刚起步,在理论上探讨得较多,真正应用到具体地区的实践案例相对较少。尽管已经制定了几个流域的示范性分区,但是直接应用到水质分区、分类和分期管理中还有一定的距离。@目前水文、水质监测能力(尤其是非点源污染 )还不够完善,未能给进行科学的、深入的水生态功能分区提供有力的科学支持。在此管理框架下也无法有效地协调跨行政、跨部门和跨流域等冲突问题。

造成这种状况的主要原因是 :污染控制未能体现“分区、分类、分级、分期”的水环境管理理念 :水体功能分区存在局限性,难以揭示中国水环境生态特征 ;流域水环境质量基准和标准体系尚不健全 ;流域水环境管理技术体系还不够完善，总量控制还缺乏有效的技术支持:对流域整体的系统性认识不足,流域规划综合决策能力较低。